Um em cada cinco genes humanos não são 'reais'
Novas pesquisas podem mudar a cara da biomedicina; descobriu-se que o genoma humano contém muito menos genes “reais” ou codificadores de proteínas do que se acreditava anteriormente.
No início da década de 1990, os cientistas começaram a mapear toda a sequência de DNA do genoma humano.
O chamado Projeto Genoma Humano teve como objetivo encontrar ligações genéticas com doenças e entender a função e a estrutura de vários elementos do genoma, como quais genes codificam proteínas e quais fatores regulam a expressão gênica.
Os resultados iniciais do Projeto Genoma Humano previram que existem 40.000 genes que podem codificar proteínas, grandes moléculas que são vitais para o bom funcionamento dos tecidos e órgãos do corpo.
No entanto, quando esse projeto chegou ao fim em 2003, as estimativas para esse número caíram para cerca de 20.000–25.000 genes codificadores de proteínas.
Desde então, os cientistas têm se esforçado para chegar ao proteoma final - ou seja, o número total de proteínas que podem ser expressas por genes - e têm se concentrado em entender como a expressão genética dessas proteínas sofre mutação em várias doenças.
Para tanto, uma equipe internacional de pesquisadores liderada por Michael Tress, da Unidade de Bioinformática do Centro Nacional de Pesquisa do Câncer da Espanha em Madri, Espanha, já examinou os genes considerados codificadores de proteínas pelos principais bancos de dados de proteoma disponíveis.
Tress e seus colegas publicaram os resultados de suas pesquisas na revista Pesquisa de ácidos nucléicos. Federico Abascal, do Wellcome Trust Sanger Institute em Hinxton, Reino Unido, é o primeiro autor do artigo.
Pelo menos 2.000 genes são ‘pseudogenes’
Os pesquisadores compararam os proteomas de três coleções de sequências de proteínas e anotações genéticas: GENCODE / Ensembl, RefSeq e UniProtKB.
Tress e sua equipe descobriram que, do número total de 22.210 genes listados como codificadores de proteínas, apenas 19.446 apareciam em todas as três coleções.
Em seguida, eles ampliaram a diferença de 2.764 genes, examinando as evidências experimentais e as informações disponíveis nas anotações.
As evidências sugeriram que a maioria desses genes eram "genes não codificadores ou pseudogenes".
Além disso, os cientistas descobriram que 1.470 genes adicionais - que foram listados como codificadores de proteínas nas três coleções - não tinham as características funcionais ou a evolução típica dos genes codificadores de proteínas.
Portanto, os pesquisadores “acreditam que os três bancos de dados de referência atualmente superestimam o número de genes codificadores humanos em pelo menos 2.000, complicando e adicionando ruído a experimentos biomédicos em grande escala”.
“Determinar quais genes não codificadores potenciais não codificam para proteínas é uma tarefa difícil, mas de vital importância, uma vez que o proteoma de referência humano é um pilar fundamental da maioria das pesquisas básicas e apóia quase todos os projetos biomédicos de grande escala.”
Orientações para pesquisas futuras
Tress compartilha como os pesquisadores estão levando suas descobertas adiante. “Fomos capazes de analisar muitos desses genes em detalhes”, explica ele, “e mais de 300 genes já foram reclassificados como não codificadores”.
“Surpreendentemente”, diz David Juan, coautor do estudo, “alguns desses genes incomuns foram bem estudados e têm mais de 100 publicações científicas baseadas na suposição de que o gene produz uma proteína”.
Os resultados podem, portanto, mudar o campo da biomedicina como a conhecemos. No entanto, mais pesquisas são necessárias.
“Nossa evidência”, acrescenta Abascal, “sugere que os humanos podem ter apenas 19.000 genes codificadores, mas ainda não sabemos quais são [esses] 19.000 genes”.
